吸入性肺脓肿最常见的感染菌是厌氧菌。厌氧菌是一类在无氧条件下比在有氧环境中生长好的细菌，而不能在空气（18%氧气）和（或）10%二氧化碳浓度下的固体培养基表面生长的细菌。它能引起人体不同部位的感染，包括阑尾炎、胆囊炎、中耳炎、口腔感染、心内膜炎、子宫内膜炎、脑脓肿、心肌坏死、骨髓炎、腹膜炎、脓胸、输卵管炎、脓毒性关节炎、肝脓肿、鼻窦炎、肠道手术或创伤后伤口感染、盆腔炎以及菌血症等。这类细菌缺乏完整的代谢酶体系，其能量代谢以无氧发酵的方式进行。

肺脓肿的致病菌有很多最常见的厌氧菌，也可合并的需氧菌的感染，吸入性肺脓肿常以厌氧菌感染为主，血源性肺脓肿常伴有金黄色葡萄球菌的感染。

如果患者确诊为肺脓肿后我们需要完善痰培养的检查，有时痰培养是查不出细菌的，主要原因为患者可能是克氧菌不易培养出来。

如果查不出细菌，我们可先于经验性治疗，尝试用对厌氧菌有效的青霉素族进行治疗，联合应用甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等对厌氧菌有效的药物，多次留痰标本，标本培养出细菌后可根据结果及药敏试验更换抗生素，同时要注意体位的引流，支持对症的治疗。